エクセルファイルを読み込むのにXLConnectライブラリ等を利用していると思います。
そんな時は、エクセルファイルをCSVに変換して読み込んでください。データをRに取り込めると思います。CSVファイルの読み込みコマンドは下記の通りです。
library("tcltk") #データが大きい場合はcsvで読む。空白はNAとする #日本語を含む場合はfileEncoding="CP932"を追加 selectACsv <- paste(as.character(tkgetOpenFile(title = "csvファイルを選択", filetypes = '{"csvファイル" {".csv"}}', initialfile = "*.csv")), sep = "", collapse =" ") Data <- read.csv(selectACsv, header = TRUE, sep = ",", na.strings = "", stringsAsFactors = FALSE) ######## #データを保存する場合 write.csv(Data, "ファイル名.csv")