heatmap

Rの解析に役に立つ記事

Rで解析:階層クラスタリングをインタラクティブに探索「visxhclust」パッケージ

「shyny」パッケージを利用して、階層クラスタリングをインタラクティブに探索できるパッケージの紹介です。デンドログラム付きのヒートマップ、相関ヒートマップ、MDSやPCAプロット、統計量を作成して探...
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Rで解析:カレンダー形式のヒートマップを作成「ggTimeSeries」

カレンダー形式のヒートマップを簡単に作成できるパッケージの紹介です。本パッケージはggplot2を基本としているので、ggplot2の操作コマンドを使用することができます。 また、カレンダー形式のヒー...
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Rで解析:ggplot2でプロットするヒートマップ「gapmap」パッケージ

ggplot2で非常に簡単にヒートマップを作成することができるパッケージの紹介です。ggplot2に慣れている方は非常に使いやすいと思います。 パッケージのバージョンは0.1.0。実行コマンドはwin...
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Rで解析:少ないコードでヒートマップ「tidyHeatmap」パッケージ

少ないコードでヒートマップを作成可能なパッケージの紹介です。細かい体裁などが得意で理想のヒートマップが作成できる「ComplexHeatmap」パッケージを基本に作成されたパッケージです。ですので、「ComplexHeatmap」パッケージと共通のコマンドを使用することができます。
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Rで解析:ヒートマップの描写に便利です!「fheatmap」パッケージ

ggplot2を利用してヒートマップを描写するパッケージです。他のパッケージと比べ、行列に付与するカラーバーデータの描写が便利です。 参考までに、これまで「からだにいいもの」で紹介しているheatma...
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Rで解析:簡単HeatMapパッケージ「pheatmap」の紹介

Pretty Heatmapsがタイトルに設定されているpheatmapを紹介します。2015年3月の時点でバージョンは1.0.2です。 このパッケージは、画像ファイルの出力がコマンド内で設定できるな...
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Rで解析:簡単なheatmapの作成! 「heatmap3」パッケージ

数や物の大小を視覚的に色で表す方法にヒートマップ(heatmap)という方法があります。heatmap3パッケージで手軽に表現できますのでご紹介します。 なお、ggplot2の拡張パッケージでもhea...
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